水稻紋枯病的發生和流行受菌源數量、氣象條件、品種抗病性、栽培技術等因素的綜合影響。
1. 菌源數量田間殘留菌核量與發病初期病情程度呈正相關。上年或上季發病重的田塊遺留的菌核多，當年或當季稻株初期發病率高。新墾稻田或上年、上季的輕病田,一般當年或當季發病較輕。
2. 氣象因素高溫、高濕有利于紋枯病的發生。當日平均氣溫穩定在22°C、水稻處于分藥期時，田間開始零星發病。我國各稻區主要發病時期有所不同。常年情況下，東南和西南稻區各季水稻生育期均適合病害發生，出現多次發病高峰；華南稻區早稻發病高峰為5?6月，晚稻為9?10月；北方單季稻區在7月下旬至8月下旬雨季時病害發生嚴重；長江中下游地區初夏氣溫偏高，盛夏多雨，氣溫偏低，紋枯病發生嚴重，早稻發病高峰在6月中旬至7月上旬，中、晚稻發病高峰在8月下旬至9月下旬。
1. 菌源數量田間殘留菌核量與發病初期病情程度呈正相關。上年或上季發病重的田塊遺留的菌核多，當年或當季稻株初期發病率高。新墾稻田或上年、上季的輕病田,一般當年或當季發病較輕。
2. 氣象因素高溫、高濕有利于紋枯病的發生。當日平均氣溫穩定在22°C、水稻處于分藥期時，田間開始零星發病。我國各稻區主要發病時期有所不同。常年情況下，東南和西南稻區各季水稻生育期均適合病害發生，出現多次發病高峰；華南稻區早稻發病高峰為5?6月，晚稻為9?10月；北方單季稻區在7月下旬至8月下旬雨季時病害發生嚴重；長江中下游地區初夏氣溫偏高，盛夏多雨，氣溫偏低，紋枯病發生嚴重，早稻發病高峰在6月中旬至7月上旬，中、晚稻發病高峰在8月下旬至9月下旬。
3. 栽培技術氮肥施用量與病害發生程度一般呈正相關。長期深水灌溉，稻叢間濕度大，有利于病菌的滋生和蔓延。水稻種植密度與發病程度有一定關系，但在一定的密度范圍（早稻120萬叢/hm2，晚稻60萬叢/hm2）之內，發病程度差異不大。
4. 品種和生育期目前尚未發現免疫品種，但水稻品種間的抗病性有一定差別。其抗病性一般規律為：粧稻最抗病，粳稻次之，糯稻最感病；窄葉高稈品種較闊葉矮稈品種抗病；遲熟品種較抗病，中熟品種次之，早熟品種最感病，這是由于早熟品種葉鞘內淀粉含量隨稻株生長而迅速下降，故垂直擴展速度快，發病較重。另外，植株體內細胞硅化程度高、纖維質和木質素含量高的品種抗病性也相應較強。
4. 品種和生育期目前尚未發現免疫品種，但水稻品種間的抗病性有一定差別。其抗病性一般規律為：粧稻最抗病，粳稻次之，糯稻最感病；窄葉高稈品種較闊葉矮稈品種抗病；遲熟品種較抗病，中熟品種次之，早熟品種最感病，這是由于早熟品種葉鞘內淀粉含量隨稻株生長而迅速下降，故垂直擴展速度快，發病較重。另外，植株體內細胞硅化程度高、纖維質和木質素含量高的品種抗病性也相應較強。
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