帶菌種子是水稻惡苗病的主要初侵染源，因此，建立無病留種田和進行種子處理是控制病害發生的關鍵措施。
1. 選用無病種子 不在病田及其附近田塊留種，應從無病區引種，剔除癟谷和受傷的種子。
1. 選用無病種子 不在病田及其附近田塊留種，應從無病區引種，剔除癟谷和受傷的種子。
2. 種子處理 25%咪鮮胺乳油2000?3000倍液浸種：先預浸種子12?24h，然后用藥液浸種24?48h，粳稻種子需要浸48?56h。藥劑浸種時藥液液面應高于谷種面20?30cm，浸種過程中應攪拌若干次。浸種后可直接催芽。也可用85%強氯精300倍液浸種，但浸種后需用清水洗凈后再催芽、播種。浸種時間視氣溫高低而定，溫度低時適當延長。其他常用藥劑有浸種靈、401抗菌劑、402抗菌劑等。
3. 加強栽培管理 妥善處理病稻草，不用病稻草作為催芽時的覆蓋物或捆秧把，以減少初侵染源。及時拔除田間病株，減少再侵染源。
3. 加強栽培管理 妥善處理病稻草，不用病稻草作為催芽時的覆蓋物或捆秧把，以減少初侵染源。及時拔除田間病株，減少再侵染源。
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